El Rector es el personero y representante legal de la Universidad. Tiene a su cargo la dirección, conducción y gestión del gobierno universitario en todos sus ámbitos, dentro de los límites de la Ley y el Estatuto. El cargo es a dedicación exclusiva.
Para ser elegido Rector se requiere:

• Ser ciudadano en ejercicio.
• Ser docente ordinario en la categoría de principal en el Perú o su equivalente en el extranjero, con no menos de cinco (5) años en la categoría.
• Tener grado académico de Doctor, el mismo que debe haber sido obtenido con estudios presenciales.
• No haber sido condenado por delito doloso con sentencia de autoridad de cosa juzgada.
• No estar consignado en el registro nacional de sanciones de destitución y despido.
• No estar consignado en el registro de deudores alimentarios morosos, ni tener pendiente de pago una reparación civil impuesta por una condena ya cumplida.

Atribuciones y ámbito funcional del Rector
Son las siguientes:

• Presidir la Asamblea Universitaria y el Consejo Universitario, así como hacer cumplir sus acuerdos.
• Dirigir la actividad académica de la universidad y su gestión administrativa, económica y financiera.
• Presentar al Consejo Universitario, para su aprobación, los instrumentos de planeamiento y gestión institucional de la universidad.
• Refrendar los diplomas de grados académicos y títulos profesionales, así como las distinciones universitarias conferidas por el Consejo Universitario.
• Expedir las resoluciones de carácter previsional del personal docente y administrativo de la universidad.
• Presentar a la Asamblea Universitaria la memoria anual, el informe semestral de gestión del Rector y el informe de rendición de cuentas del presupuesto general ejecutado.
• Transparentar la información académica, económica y financiera de la universidad.
• Cumplir y hacer cumplir las leyes, el Estatuto, reglamentos, los planes de funcionamiento y desarrollo y demás disposiciones relativas a la Universidad.
• Informar al Consejo Universitario sobre su gestión como representante de la Universidad. Celebrar convenios con universidades, organismos públicos o privados nacionales o extranjeros, dando cuenta al Consejo Universitario.
• Proponer ante el Consejo Universitario la designación del Secretario General y del Director General de Administración y las demás direcciones universitarias.
• Proponer al Consejo Universitario la solicitud de créditos a nombre de la Universidad.
• Velar por la autonomía de la Universidad de acuerdo a Ley y denunciar los casos que atenten contra ella.
• Delegar funciones de autoridad y responsabilidad a los vicerrectores, decanos o al profesor principal, cuando las circunstancias lo requieran, con cargo a dar cuenta al Consejo Universitario.
• Las demás atribuciones que la Ley, el presente Estatuto y demás reglamentos de la Universidad le otorgue